La flora silvestre de esta región es particularmente diversa, comprende especies de 9 zonas de vida distintas, incluyendo especies típicas de los bosques andinos, como el Polylepissp, en las partes altas, hasta epífitas, arbustos y palmas típicas de los bosques montanos, a menor altitud. Los principales grupos taxonómicos son pteridofitos (helechos), gimnospermas, monocotiledóneas, dicotiledóneas, criptogamas, orquídeas, poaceas, árboles, moraceae, symplocaceae, polylepis (rosaceae), ericaceae, flora vascular y no vascular.
Pese a los conflictos ambientales graves, ha significado la recuperación de la fauna silvestre en algunos sectores. La presencia reciente de individuos como el "oso de anteojos" (Tremarctosornatus) y "mayu puma" (Lontralongicaudis), en los km 107 y 112, es un testimonio positivo.
