Contiene Variada colección de piezas arqueológicas y piezas históricas del Combate del Dos de Mayo y de la revolución de Arequipa. Pinacoteca. Sede arequipeña del Museo Naval con muestras de la participación de la Marina de Guerra en la región del Lago Titicaca.

Se encuentran colecciones precolombinas de las culturas Moche, Chimú e Inca; además de tribus de la Amazonia, utensilios e indumentarias; de arte religioso, con lienzos y objetos litúrgicos, así como pinturas de la escuela cuzqueña e italiana.

El Convento de Santa Catalina también conocido como Monasterio de Santa Catalina es uno de los más importantes monumentos religiosos coloniales del Perú, sus calles llevan el nombre de ciudades españolas, sus celdas son pequeñas casas equipadas incluso con cocina. Un remanso de paz y belleza en el corazón de la ciudad de Arequipa.

En este complejo se exhibe una amplia gama de valiosos objetos de piedra y cerámica prehispánica, además de restos óseos. Estos se han encontrado durante arduas investigaciones arqueológicas que han sido financiados en su totalidad por la universidad, durante los últimos 35 años.

Expone objetos cerámicos, textiles, fardos funerarios, líticos de madera y metal de los desarrollos culturales de Nazca, Tiawanaku, Wari, La Ramada, Churajón, Acari e Incas.